第六条 申请转基因棉花种子经营许可证，应当向审核机关提交以下材料：
（一）转基因棉花种子经营许可证申请表；
（二）营业执照复印件；
（三）种子检验、加工等设施设备清单和购置发票复印件；种子检验室、加工厂房、仓库的产权证明复印件；晒场的产权证明（或租赁协议）复印件，或者种子干燥设施设备的产权证明复印件；计量检定机构出具的涉及计量的检验、包装设备的检定证书复印件；相关设施设备的情况说明及实景照片；
（四）种子检验、加工、贮藏等有关技术人员的资质证明及劳动合同复印件；专职的农业转基因生物安全管理人员情况说明及劳动合同复印件；
（五）品种审定证书及农业转基因生物安全证书复印件；经营具有植物新品种权的转基因棉花种子，还应当提交品种权人的书面同意证明；
（六）农业转基因生物安全管理、防范措施说明；
（七）农业部规定的其他材料。
第七条 审核机关应当自受理申请之日起20个工作日内完成审核工作，并签署审核意见上报核发机关。审核时，应当对营业场所、加工仓储设施、检验设施设备进行实地考察并查验有关证明材料原件。
核发机关应当自收到申请材料和审核意见之日起20个工作日内完成核发工作。核发机关认为有必要的，可以进行实地考察。符合条件的，发给转基因棉花种子生产、经营许可证并予公告；不符合条件的，书面通知申请人并说明理由。
第八条 转基因棉花种子生产许可证编号为“__（x）农种生许字（x）第x号”，“__”上标注“g”，第一个括号内为发证机关简称，第二个括号内为首次发证年号，第三个号码为四位顺序号。
转基因棉花种子经营许可证编号为“__（x）农种经许字（x）第x号”，“__”上标注“g”，第一个括号内为发证机关简称，第二个括号内为首次发证年号，第三个号码为四位顺序号。
第九条 转基因棉花种子生产许可证有效期为3年，经营许可证有效期为5年，同时不得超出农业转基因生物安全证书规定的有效期限。
第十条 转基因棉花种子生产、经营许可的其他事项，按照《农作物种子生产经营许可管理办法》有关规定执行。
第十一条 本规定自2011年10月7日起施行。本规定施行之日前已取得转基因棉花种子生产、经营许可证，且有效期在本规定施行之日至2012年10月7日届满的企业，其许可证的有效期自动延展至2012年10月7日，但农业转基因生物安全证书的有效期在2012年10月7日前届满的，该企业转基因棉花种子生产、经营许可证的有效期以安全证书的有效期为准。