淡水小龙虾的胚胎发育时间较长，水温18-20℃时，需25-30天，如果水温过低，孵化期最长可达两个月。亲虾在抱卵过程中隐藏于角落，尾扇弯于腹下保护卵粒。遇到惊吓时，尾扇紧抱腹部迅速爬跑，偶尔也作短暂弹跳。整个孵化过程中，亲虾的游泳足会不停的摆动，形成水流，保证受精卵孵化对溶氧的需求，同时亲虾会利用第二和第三对步足及时剔除未受精的卵和病变、坏死的受精卵，以保证受精卵孵化的顺利进行。
刚孵化出来的仔虾即似成虾，但体色较淡，呈淡黄绿色，尾扇没有打开，经过三次蜕壳才会打开尾扇。小龙虾亲虾有护幼习性，仔虾脱膜后不会立即离开母体，仍然会附着在母体的游泳足上，直到仔虾完全能独立生活才会离开母体。刚离开母体的仔虾一般不会远离母体，母体的周围活动，一旦受到惊吓就会立即重新附着到母体的游泳足上，以躲避危险。仔虾在母体周围会生活相当长一段时间，才会逐步离开母体独立生活。由于小龙虾雌虾有抱卵、护幼的习性，对卵粒以及仔虾保护较好，所以一般孵化率都在90%以上，加之生活力较强，故繁殖量大。