要注意保持鸭棚和运动场的排水良好，地面干爽，并要求天天打扫卫生，垫料要经常更换。食槽、饮水器要经常洗刷，饲料与饮水要保持新鲜、清洁。对鸭生活的场地、用具要坚持定期消毒，减少病原菌生存和繁殖的机会。发生传染病时要迅速隔离病鸭，病死的鸭不要到处乱宰乱丢弃。污染的地方进行紧急消毒。常用的消毒方法有：
自然消毒 有些病源体怕太阳晒（太阳光里有能杀菌的紫外线）和怕干燥。所以用太阳照射，是一种最普遍、最经济的消毒方法，也叫自然消毒。使所用的鸭舍通风干燥，用具与工具常放在阳光下暴晒，能将一部分病原菌杀死。
煮沸消毒 把要消毒的器具物品如注射器、针头、衣帽等，放在开水里煮沸15分钟以上。
火焰消毒 将病鸭分泌物污染的垫草、饲料、杂物等用火烧掉，用具笼舍墙壁等用火焰（如喷灯的火焰）烤烘，可杀死某些病原菌。
药物消毒 也叫化学消毒，现介绍几种。
生石灰 用新鲜生石灰1千克加水1千克，调成奖状，然后再加水4千克，配成20%石灰乳。一般用来喷洒消毒鸭舍的墙壁、地面等。
草木灰 用玉米杆、麦秆、稻草、杂草、树枝等烧成灰。取十千克水、2千克草灰或3千克木灰，一起放入锅里煮一小时，不断搅拌，最后再加入热水以补足已蒸发的水量，等石灰沉下，虑出药液，就可用于喷洒或洗刷消毒栏舍、食槽、饮水器、用具等。草灰吸水力比木灰强，煮时可多加一些水。
来苏儿 药店有售，是黄褐色的液体，易溶于水，一般常用3%--5%的溶液（即50千克水加来苏儿1.5--1千克），可用来洗手、洗刷消毒用具或喷刷消毒栏舍。
烧碱（氢氧化钠）。用市售品配成1%--2%的热水溶液（即50千克热水中加入0.5--1千克烧碱），用来喷洒毒棚舍地面、墙壁、食槽、运动场地等。
高锰酸钾 药店有售，配成0.01%的溶液（即1千克水加入0.1克高锰酸钾），用于地面、墙壁、用具浸洗或洗刷消毒。如作为饮水消毒，需现配置成浓度0.02%--0.03%的溶液（即1千克水加入0.2克或0.3克高锰酸钾）。