自2007年7月1日起《中华人民共和国农民专业合作社法》实施以来，我州畜牧专业合作社得到快速发展，现有畜牧专业合作社162个，其中生猪86个、肉牛6个、奶牛3个、羊24个、家禽36个、蜂4个、兔3个。获评省级示范社4个，州级示范社12个，正在申报国家级示范社1个。合作社成员总数8722人,总资产6.88亿元,固定资产4.25亿元,销售总收入4.64亿元，带动农户9.64万户。
近年来，政府对合作社的扶持力度逐年加大。2011-2014年，全州畜牧专业合作社已得到各级财政575万元的项目资金支持，对推动合作社的发展壮大起到了至关重要的作用。但是，由于合作社发展中存在诸多问题， 4年中只有10个畜牧专业合作社申报项目成功，年获项目资金扶持率仅为1.5%，比例远远低于州内农业和全省其它同行业水平。目前，我州畜牧专业合作社存在的问题主要表现在：一是空壳社较多，一般都只停留在工商登记注册层面，没有开展实质性工作。二是社员太少，示范带动作用不强。三是管理松散和混乱，运作不规范。四是人才缺乏，领头人开拓意识较差。五是业务内容单一，社员收益不高。六是发展定位不明确，盲目跟风现象突出。七是资金短缺，发展困难。八是部门服务意识不强，工作指导力度有待提高。这些问题的存在，严重制约了我州畜牧专业合作社的健康发展。
当前，新一轮深化农村改革的大幕即将拉开，加强合作社建设和规范合作社发展意义重大，这既是加快培育我州新型农业经营主体，快速构建新型农业经营体系，有效推进农业现代化的重要举措，又是维护合作社成员合法权益，增强合作社发展内生动力的客观要求，更是承接国家涉农项目，创新财政支农方式的重要基础。各级各部门应加强宣传，强化督促指导，把合作社规范化建设和发展摆到重要议事日程，突出合作社发展的重要地位，不断提高合作社发展质量和水平，充分发挥合作社在新型农业经营主体中的重要作用。