此前发给种粮农民的农作物良种补贴、种粮农民直接补贴和农资综合补贴“三项补贴”,2016年将合并为农业支持保护补贴。财政部、农业部4月25日发文宣布今年在全国全面推开农业“三项补贴”改革，让农业补贴资金发挥更大效能。
2015年，经国务院同意，财政部、农业部曾发文选择部分省试点推进这项改革。此次两部门发布的《关于全面推开农业 “三项补贴”改革工作的通知》除了明确试点将推向全国，还对今后财政支农补贴资金如何使用作出具体规定。
此次改革后，80%的农资综合补贴存量资金，加上种粮农民直接补贴和农作物良种补贴资金，将用于耕地地力保护。两部门明确，这部分资金的补贴对象原则上为拥有耕地承包权的种地农民；对已作为畜牧养殖场使用的耕地、林地、成片粮田转为设施农业用地、非农业征（占）用耕地等已改变用途的耕地，以及长年抛荒地、占补平衡中“补”的面积和质量达不到耕种条件的耕地等不再给予补贴。
改革后，20%的农资综合补贴存量资金，加上种粮大户补贴试点资金和农业 “三项补贴”增量资金，统筹用于支持粮食适度规模经营。两部门明确，这部分补贴资金原则上以2016年的规模为基数，每年从农业支持保护补贴资金中予以安排，支持对象重点向种粮大户、家庭农场、农民合作社和农业社会化服务组织等新型经营主体倾斜，体现“谁多种粮食，就优先支持谁”。
目前，中央财政已将2016年用于耕地地力保护的农业支持保护补贴资金全部提前下达。两部门要求各地抓紧制定实施方案，务必于6月30日前将需兑现到农民手中的补贴资金发放到位。