1、病原 此病的病原物是蜜蜂马氏管变形虫（Malipighamoeba mellificae），它在动物分类中属于原生动物门，肉鞭毛虫亚门，原肉纲。
这种变形虫没有伸缩泡，只有一个细胞核。伪足是它的分类特征，可随不同情况而改变。当环境因素不良时，可形成孢囊。孢囊呈卵形或球形，大小为6~7微米，孢囊可随病蜂粪便排至体外。
蜜蜂马氏管变形虫寄生在蜜蜂的马氏管中，繁殖迅速，能阻塞马氏管的管腔，破坏马氏管正常的排泄功能，使病蜂非常衰弱。
2、病征和诊断 蜜蜂马氏管变形虫病没有典型的症状，主要表现是蜂群发展缓慢，群势逐渐减弱，而在群内和蜂箱周围很少见到死蜂，这是由病蜂大都死在野外。患变形虫病的病蜂也有腹部膨大和下痢的症状。
蜜蜂马氏管变形虫病的诊断主要依靠显微镜检查病蜂肠道中是否有孢囊存在。具体方法是：解剖病蜂，取出消化道，置于载玻片上，去掉蜜囊和直肠，留下中肠和小肠，加一滴无菌水将其浸没，用低倍镜检查，若发现马氏管膨大并近于透明，管内充满形如珍珠般的孢囊，用解剖针将马氏管弄破时，能见到变形虫的孢囊散落在水中，即可确诊为马氏管变形虫病。
3、发病与传播 当蜜蜂吞进马氏管变形虫的孢囊时，感染即开始。孢囊在蜜蜂的肠道内破裂即释放出变形虫的营养体，随后营养体进入蜜蜂的马氏管内生长繁殖，使马氏管遭受严重破坏而丧失其功能，这时，由于马氏管内的环境已经变得不适宜营养体的生长繁殖，营养体便大部分变为孢囊，并随蜜蜂的排泄物一齐排出体外，被其他的蜜蜂食入时，又可产生感染。蜜蜂马氏管变形虫病单独发生不会给蜂群带来严重的损失，但如果与孢子虫病同时发生，而又未及时治疗，则很容易毁掉蜂群。
被变形虫的孢囊污染的饲料和巢脾，水源都是这种蜂病的传播媒介。
在自然条件下，蜂王很少被感染。
4、防治方法 与孢子虫病的防治方法相同。
三、簇虫病和鞭毛虫病
1、簇虫 这是一种较大的原生动物，分为有头簇虫和无头簇虫两种。
簇虫可寄生于成年蜂的中肠腔中，粘附在肠道的上皮组织上。
簇虫在蜜蜂体内繁殖后包在胞囊中经由直肠排出。簇虫寄生仅仅造成蜜蜂肠道的损伤。
2、鞭毛虫 在成年蜂消化道的幽门部背面有一小块上皮组织中常常聚集一种名为蜜蜂鞭毛虫（Leptomonas apis）的原生动物，使蜜蜂的肠壁上出现暗点或痂皮，在该处形成“皮毛状”的结节。
这种鞭毛虫在不足6日龄的幼蜂体内是不会发生感染的，形成暗斑都是在大于16日龄的蜜蜂中。越冬蜂体内没有鞭毛虫。