黄鳝的养殖难点，在于出现暴发性死亡，其原因主要是受伤、药害和疾病三方面。
黄鳝在自然环境中抗病力很强，是因为没有人为造成的损伤。而黄鳝的体表一旦受伤后，就为病原微生物的侵染打开了大门。人工养殖高密度的黄鳝，在人为控制的环境下一时很难适应，必然产生应激反应。黄鳝自然繁殖率较低，而人工繁殖技术尚未过关，因此人工养鳝只能从市场上收购鳝苗。收来的黄鳝无论是笼捕还是电捕，都有不同程度的内外伤，易发病。黄鳝一旦发病，一般药物难以奏效。电捕鳝、笼捕鳝、药捕鳝致伤是造成黄鳝养殖成活率普遍不高的根本原因。防治病害的关键技术是：
一、引种严格把关，不收电捕鳝、药捕鳝，对笼捕鳝中伤残体弱以及肛门淡红色的黄鳝坚决剔除。
二、黄鳝池必须用生石灰150ppm～200ppm或“万消灵”10ppm彻底消毒。放养前鳝体用4%食盐水消毒10分钟左右。养鳝过程中经常用二氧化氯2.5ppm、氯霉素3ppm泼洒消毒，并注意将痢特灵、氯霉素加入含有蚯蚓的配合饲料中，制成药饵投喂。
三、每平方米水面放养数量控制在100尾以内，以减少黄鳝的应激反应。
四、黄鳝对氧气的要求较高，水质要活。因此人工微流水养鳝，比较适合黄鳝养殖的生态要求。实现鳝蚓合养，让黄鳝摄食营养比较全面的蚯蚓饵料，增强抗病能力。
五、遮荫降温防暑。黄鳝生长适温为15℃～28℃，夏季水温过高，黄鳝易中暑死亡，要在养鳝池中栽种水葫芦、水花生等植物，同时在池的上方搭葡萄架、瓜架遮阳。