理解水产养殖系统中的氨并进行控制是很关键的。如果氨积累了，对鱼类是有毒的，并可能有损于任何鱼类生产系统。氨浓度一旦达到毒性水平，鱼类就不能从其饲料中获取所需的能量。如果氨浓度达到足够高的水平，鱼类将会变得迟钝，昏昏沉沉，最终可能导致死亡。
在合理管理的水产养殖池塘环境中，氨很少积累到致死浓度。然而，虽然不会导致死亡，但会有负面影响：生长速度降低、饲料转换率差，抗病能力下降等。所以，即使鱼类没有死于直接的氨中毒，但会以其他方式影响生产系统，最终影响整体养殖效果。
一、氨的动力学
单一的一次测量只能提供测量样品那一瞬间的氨浓度。氨的生产、清除和转化过程是很复杂的，一整年的养殖过程中都在不断变化。只有在不同时间采样和记录的数据才能反映氨影响水产养殖系统过程更详细、更准确的信息。
氨主要来源于鱼类的排泄。其排泄率直接与投饵率以及所使用的饲料蛋白质水平直接有关。随着饲料蛋白在鱼体内分解，一些饲料蛋白用于形成鱼体蛋白（肌肉），另一些饲料蛋白作为能源，所产生的氨通过鳃排出。饲料中的蛋白质是投喂饲料的池塘中大多数氨的首要来源。
氨的另一个主要来源是从池塘底泥扩散出来的。大量的有机物质或由藻类所产生或作为饲料投入到池塘中。粪便固体和死亡藻类沉淀到池塘底部并开始分解。这一过程会产生氨，并从底部淤泥扩散到水体中。
二、氨的汇
幸运的是，有几个过程可以导致氨的流失或转化。最重要的过程是氨通过藻类和其他植物的吸收而流失。植物以氮作为一种营养物质用于生长。光合作用就像一块海绵一样吸收氨，所以池塘中整体植物或藻类的生长可以帮助氨的利用。当然，植物生长过多对溶解氧水平的昼夜变化有影响，会导致夜间溶解氧非常低。
氨的另一个清除过程是氨的转化，即通过硝化。在水产养殖环境中有两种主要类型的细菌，硝化细菌和亚硝化细菌，通过两步过程有效地氧化氨。第一步是将氨转化为亚硝酸（NO2-），再转化为硝酸（NO3-）。从根本上讲，硝化是氮复合氧化的过程（氮原子失去电子并有效地转移到氧原子上）。
有几个因素影响硝化的速度，理解这些因素并在不同时间测量氨，可以为明确的管理决策提供更好的理解。氨浓度、温度和溶解氧浓度都起着主要作用。在夏季，氨浓度通常是非常低的，硝化的速度以及处理过剩的氨的细菌类群也是很低的。在冬季，低温抑制微生物的活性。然而，在春季和秋季，氨的浓度和温度的水平有利于更高的硝化速度。在许多池塘，春季和秋季往往是亚硝酸浓度的高峰期。
水产养殖撒药
三、最有可能的氨问题
美国环境保护署(EPA)基于氨(氮)接触时间建立了三种标准(一种急性和两种慢性)。急性的标准是1小时平均接触浓度，是PH值的函数。一个慢性标准是30天的平均浓度，是PH值和温度的函数。另一个慢性标准是在30天内最高的4天的平均浓度，以30天慢性标准的2.5倍计算。EPA的标准有助于确定什么时候氨可能有问题。
与一般的推测相反，冬季的氨浓度往往（2.5-4.0mg/L或更高）要比夏季(~0.5mg/L)更高。冬季氨(氮)的30天慢性标准的范围大约为1.5-3.0 mg/L，取决于PH值。在冬季的某些时间段，当鱼类免疫系统被低温抑制时，氨浓度可能会超过这些值。