从事水蛭养殖，进入秋季就要做好种水蛭的安全越冬工作。入冬后，气温降至10℃以下，水蛭开始停止摄食。早春期间放养的水蛭已生长成成体了，这时选出个体大、健壮的留作种用，每亩应留10-15千克，将它们集中投入育种池内越冬，其余的水蛭全部加工后出售。
水蛭耐寒力强，它们各有自身越冬的办法，北方寒冷的冬天一般也不会冻死。如医蛭入冬后进人排水沟中或水田下或就地钻人比较松软的土内越冬，潜伏深度为7-15公分；金钱蛭冬季蛰伏泥土中越冬。
有条件的养殖户可采用大棚温室，打破水蛭的冬眠习性，可周年生长繁殖，增加经济效益。
在没有采取措施的冬季，要做好冬眠前的处理工作，越冬之前多增加一些营养丰富的饵料，要以能量饵料为主，以增加体内的脂肪，为水蛭进入冬眠后有充足的能量做准备。一般情况下，水蛭在水温10℃以下开始停食，陆续钻入土中。可在池的四周把土挖松，当温度在5℃以下时即进人冬眠状态。在早春投放的种水蛭，繁殖的幼蛭此时一般都已长大，将水排干，把第二年要做种蛭的留下，集中投入育种池中越冬。
水蛭养殖
人工养殖水蛭的越冬方法比较简单，现介绍两种方法，供参考。
1、自然环境下越冬
在自然条件下，水蛭在气温低于10℃以下时通常躲在泥底下越冬，不再活动、吃食。可在养殖池。沟的上面和四周，也就是在水蛭栖息地盖上干稻草或草帘子等，让它们在自然环境下而平安地在土中冬眠，保存体内能量。待翌年气温转暖后，能很快地出来活动、取食。这种自然过冬法，能避免大批水蛭冻僵或死亡，也节省费用、省力，适合于大面积商品水蛭的养殖。
2、人工塑料暖棚越冬
将育种水蛭移入塑料薄膜棚内越冬。在池、沟的顶上用竹子或钢筋搭建成“人”字形顶棚，高度不宜过高。上面盖两层塑料薄膜，与池边连接成一密封的保温罩，利用充足的日光取暖保温。在四周用泥将薄膜密封，薄膜上再盖一层疏网，以防冬季大风把薄膜吹翻。棚四周要筑排水沟，防止雨水大量流入棚内。
随着北方冷空气南下，当外界气温下降时，将薄膜密封，并盖上一层稻草帘子。晴天掀开，利用日照保温，也可通气，半月喂一次食。这种方法能保持一定的温度，使留种的水蛭正常生长和活动。待进入春天气温回升即可交配、产卵茧。