无公害蔬菜并不等于有机蔬菜，有不少人把两者混淆起来，其实无公害蔬菜和有机蔬菜都是洁净蔬菜，但它们有相同的地方，也有不相同的地方。
相同点：首先无公害蔬菜与有机蔬菜两者的生产基地（环境）都没有遭到破坏，水（灌溉水），土（土壤），气（空气）没有受到污染；其次两者的产后（包括采收后的洗涤，整理，包装，加工，运输，贮藏，销售等环节）没有受到二次污染。
不同点：有机蔬菜在生产过程中不使用化肥，农药，生物调节剂等化学物质；不使用基因工程技术，同时还必顺经过独立的有机食品认证机构全过程的质量控制和审查，充许使用有机肥料主要用于基肥，不用化学农药，耐用防虫网或生物农药及其它非化学手段防治病虫害。而无公害蔬菜是不用或少用化肥和化学农药，其产品的残留量经测定在国家规定的范围内的称绿色无公害蔬菜。
因此，有机蔬菜与无公害蔬菜有相同的地方，也有不相同的地方，有机蔬菜也是无公害蔬菜，而无公害蔬菜就不一定是有机蔬菜。