猪舍内对猪的健康有不良影响的气体统称为有害气体，猪舍有害气体通常包括氨（NH3硫化氢（H2S二氧化碳（CO2一氧化碳（CO等，主要是由猪只呼吸产生、或由粪尿腐败分解而产生。冬季为了保暖，对猪舍采取一些封闭措施，这些措施或多或少影响到猪舍的通风，有害气体相对多了起来，对猪的极为有利，希望引起广大养猪户的注意。
氨气为无色、易挥发、具有安慰生气味的气体，比空气轻，易溶于水。氨气常易溶解在猪只呼吸道粘膜和眼结膜上，使粘膜充血、水肿，引起 结膜炎、支气管炎、肺炎、肺水肿；氨亦可通过肺泡进入血液，低浓度氨气作用于中枢神经系统，可使呼吸和血管中枢兴奋，高浓度氨气可引起中枢神经麻痹、肝中毒和心肌损伤等。低浓度氨气长期作用于猪，可导致猪的抵抗力降低，发病率和死亡率升高，生产力下降。带仔母猪舍氨气浓度要求不超过15mg/m3其余猪舍要求不超过20mg/m3
硫化氢为无色、易挥发，具有恶臭的气味，易溶于水，比空气重，越接近地面浓度更高。硫化氢易溶附呼吸道粘膜和眼结膜上，并与钠离子结合成硫化钠，对粘膜产生强烈刺激，引起眼炎和呼吸道炎症。处于高浓度硫化氢 猪舍中，猪只畏光、眼流泪，发生结膜炎、角膜溃疡，咽部灼伤，咳嗽，支气管 炎、气管炎发病率很高，严重时引起中毒性肺炎、肺水肿等。临时处于低浓度硫化 氢环境中，猪的体质变弱、抵抗力下降，增重缓慢。硫化氢浓度为30mg/m3时，猪变得怕光、丧失食欲、神经质，高于80mg/m3可引起呕吐、恶心、腹泻等。猪舍中硫化氢含量不得超过10mg/m3
二氧化碳为无色、无臭、略带酸味的气体。二氧化碳无毒，但舍内二氧化碳含量过高，氧气含量相对缺乏，会使猪只出现慢性缺氧，精神萎靡、食欲下降、增重缓慢、体质虚弱，易感染慢性传染病。猪舍内二氧化碳含量要求不超过0.15%0.2%
一氧化碳是无色、无味气体，难溶于水，用火炉采暖的猪舍，常因煤炭燃烧不充分而产生。一氧化碳极易与血液中运输氧气的血红蛋白结合，与血红蛋白的结合力比氧气和血红蛋白的结合力高200300倍。一氧化碳较多地吸人体内后，可使机体缺氧，引起呼吸、循环和神经系统病变，导致中毒。
妊娠后期母猪、带仔母猪、哺乳仔猪和断奶仔猪舍一氧化碳不得超过5mg/m3种公猪、空怀和妊娠前期母猪、育成猪舍一氧化碳不得超越15mg/m3育肥猪舍不得超过20mg/m3以上值均为一次允许最高浓度。
以上有害气体在浓度较低时，不会对猪只引起明显的外观不良症状，但临时处于含有低浓度有害气体的环境中，猪的体质变差、抵抗力降低，发病率和死亡率升高，同时采食量和增重降低，引起慢性中毒。这种影响不易觉察，常使生产蒙受损失，应予以足够重视。
生产中，冬季不能单纯追求保温而关严门窗，必需保证适量的通风换气，使有害气体及时排出。氨和硫化氢易溶于水，湿润的猪舍，氨和硫化氢常吸附在湿润的地面、墙壁和顶棚上，舍内温度升高时又挥发出来，很难通过通风而排出，因此，猪舍内做好防潮和保暖可以适当减少舍内有害气体含量。此外，垫草具有较强的吸收有害气体的能力，猪床铺设垫草也可减少有害气体。
猪舍内的尘埃和微生物少部分由舍外空气带入，大部分则来自饲养管理过程，如猪的采食、活动、排泄、清扫地面、换垫草、分发饲料、清粪、猪只咳嗽、呜叫等。
猪舍尘埃主要包括尘土、皮屑、饲料和垫草粉粒等。尘埃数量可用单位体积空气中尘埃的重量或数量来表示，一般情况下，舍内含尘量在103106个/m3之间，翻动垫草可使灰尘量增大十倍，不同类型、不同卫生状况的猪舍其含尘量差异也较大。
尘埃自身对猪有刺激性和毒性，同时还因它上面吸附有细菌、有毒有害气体等而加剧了对猪的危害水平。尘埃降落在猪体表，可与皮脂腺分泌物、皮屑、微生物等混合，安慰皮肤发痒，继而发炎。尘埃还可堵塞皮脂腺，使皮肤干燥，易破损，抵抗 力下降，尘埃落入眼睛可引起结膜炎和其它眼病，被吸入呼吸道，则对鼻腔粘膜、气管、支气管产生刺激作用，导致呼吸道炎症，小粒尘埃还可进入肺部，引起肺炎。
母猪舍尘埃含量，带仔母猪和哺乳仔猪舍昼夜平均不得大于1.0mg/m3育肥猪舍不 得大于3.0mg/m3其它猪舍不得高于1.5mg/m3
大气空气因较干燥，缺乏营养物质，太阳辐射的紫外线又有杀菌作用，对微生物的生存有利。但空气中飘浮着许多灰尘，微生物可附着其上面生存。空气中微生物含量一般春夏季比秋冬季高，雨雪天比刮风时少。猪舍内空气中尘埃多，阳光紫外线弱，微生物来源多，因此舍内空气微生物含量远比大气高，不同猪舍微生物含量因其通风换气状况、舍内猪的种类、密度等的不同而变异较大，如肥猪舍有细菌35105个/m3通风不良时可达106个/m3带仔母猪舍可有47105个/m3
空气中微生物类群是不固定的一般情况下大多为腐生菌，还有球菌霉菌、放线菌、酵母菌等等，有疫病流行的地区，空气中还会有病原微生物。空气中病原微生物可附在尘埃上进行传播，称为灰尘传染；也可附着在猪只喷出的飞沫上传播，称为飞沫传染，猪只打喷嚏、咳嗽、鸣叫时可喷出大量飞沫，多种病原菌可存在其中，引起病原菌传播。通过尘埃传达的病原体，一般对外界环境条件抵抗力较强，如结核菌、链球菌、绿脓球菌、葡萄球菌、丹毒和破伤风杆菌、炭疽芽胞、气肿疽梭菌等，猪的炭疽病就是通过尘埃传达的通过飞沫传播的主要是呼吸道传染病，如气喘病、流行性感冒等。
要减少猪舍空气中的尘埃和微生物，必需在建场时就合理设计，正确选择场址，合理布局场区，防止和杜绝传染病侵入；舍内应及时清除粪污和清扫圈舍，合理组织通风，定期消毒等。