1、疫苗免疫
对猪场不同猪群的猪只进行不同的疫苗接种是保障猪场安全生产的基础，给猪只接种疫苗，可以抑制猪场疾病的发生。
2、消毒
消毒是保障猪场安全生产的一个非常重要的措施。猪场的许多病原微生物可以通过消毒工作来达到杀灭和抑制其传播的效果。
3、引种与隔离不当
猪场在生产过程中一般都要坚持自繁自养的原则，但是，由于原有猪群的生产力下降或老龄化，为了追求更高的经济效益，需要不定时的更换猪的品种。如果对新引进的猪隔离措施不当，会对原有猪群的安全生产带来一定的风险。引进种猪时，要安排适当的圈舍，与其他猪隔离饲养30～45天，并随时观察其健康状况。在隔离期内未发生任何疾病，方可混群饲养。
4、病死猪及胎衣的处理不当
集约化猪场应有病死猪及胎衣处理的专门场所，对病死猪只进行焚烧或深埋，也可在粪场附近设置一沉尸井，最好、最安全的方法是用焚尸炉将病死或剖解猪只及胎衣进行无害化处理。一般情况下，对病死或剖解猪只及母猪产后的胎衣应立即无害化处理，否则，容易造成病原微生物的扩散。影响其他正常猪群的健康生长。
5、疫病检测不及时
在集约化养猪条件下，应进行经常性的疫病检测工作，以便对场内疫病情况、免疫质量、疫病净化水平进行监控，同时也为本场的防疫工作提供客观依据。尤其本地区、本季节爆发和流行严重的传染病更应该加强检测，以便作出及时反应。同时，对场内使用的疫苗、消毒剂的质量也要进行检测。以保证确实有效。如不能及时的做好以上工作。就不可能准确和深入的了解猪场疾病的流行和发展趋势。就不可能及时的采取有效的防治措施，从而影响猪群健康地生长发育。
6、疫病发生时没能及时的采取有效的措施
猪场如遇到或怀疑是传染病发生时，必须及时隔离，尽早诊断并尽快上报，病因不明或不能确诊时，应将病料送有关部门紧急检验。如确诊为传染病时，应迅速采取紧急措施，对全场进行封锁和消毒。全场猪群进行检疫，病猪隔离治疗或屠宰、焚烧。健康猪只进行紧急预防接种或药物预防。并对被污染的场地、用具、环境及其他污染物进行彻底消毒。反之，则容易延误最佳防治和治疗时机，造成疫情的扩散和蔓延，给猪场造成更大的经济损失。
7、在疫病防制方面主次不分
猪场的防疫工作，要结合本地和本场的实际情况。分清主次。有针对性地对某些危害性强、发病频率高的疫病，根据其流行特点、发病规律采取切实有效的措施，针对性地预防和治疗。反之，一方面造成人力、财力的浪费，另一方面也起不到对疫病的防制效果。
8、防疫措施不完善
传统的养猪防疫似乎仅仅是兽医份内的工作。而且是季节性的。集约化猪场的防疫则是全方位的、常年的。除常规的消毒、免疫、治疗外，还需要加强管理，保证营养平衡，优化场区和畜舍环境。猪场内的诸多因素都和防疫效果有着直接或间接的关系，因此集约化猪场的防疫措施要形成配套的体系。
9、不重视猪群的保健
猪场在生产过程中，往往在消毒和疫苗免疫方面投入很大的精力。这当然是猪场防疫不可缺少和关键的步骤。但是，对猪群的保健，也是猪场防疫不可缺少的一个重要方面。当然，对猪群进行保健，需要投入一定的财力，会增加饲养成本，但是可以提高猪群的健康水平，提高猪只对疾病的抵抗能力，降低猪场发生疫情的风险。
10、对猪场整体环境的治理不重视
猪场的环境卫生体系是以传统的防疫保健为基础，以猪的生物学特性为根据。要求规模养猪在生产过程中。通过完善猪场内外布局和猪舍内部的工艺设计等一系列措施，给猪群提供一个良好的生长和繁育的环境。定期的对猪体内外进行驱虫和杀灭蚊蝇和老鼠，消灭疾病的传播媒介，减少猪只疾病发生的机会。定期清除杂草和填埋阴沟，消灭病原微生物的孳生地。经常保持猪舍内空气新鲜、干燥、温度适宜、干净卫生，可以在很大程度上提高猪群的健康水平。
对猪场周围和场区空闲地进行植树种草（包括蔬菜、花草、灌木等）绿化环境，对改善小气候有重要的作用，一般要求猪场内的道路两侧种植行道树，每幢猪舍之间都要栽种速生、高大的落叶树（如水杉、白杨树等），场区内的空闲地都要遍种蔬菜、花草和灌木。有条件的猪场最好在场区外围种植5～10米宽的防风林。
猪舍若能置于这样的环境中，带来的好处是：在寒冷的冬季可使场内的风速降低70%～80%;又能使炎热的夏季气温下降10%～20%;还可将场内空气中有毒、有害的气体减少25%：臭气减少50%;尘埃减少30%-50%：空气中的细菌数减少20%～80%。
生活在这样一个绿化美化环境中。不仅能使长期在猪场工作的人员感到心旷神怡。也能使终生关在笼舍内的猪感受到清晨闻啼鸟，夜听虫蛙鸣，阵阵青草香，飓飓风雨声，仿佛又回归到大自然。
所以猪场整体环境的治理是猪场安全防疫的一个重要环节。
总而言之。养猪场综合防疫体系的建立和实施是一个不断修改和完善的过程。防疫体系内的众多环节必须环环相扣、节节相连、步步到位。才能充分发挥综合防疫体系的作用。保障猪场生产的安全性和效益性。