生猪人工授精操作方式不当，会造成母猪生殖道感染、复配率高、产仔数少等。
一是母猪的外阴消毒问题。这个问题往往不被重视，有的农户为了操作方便省事，对母猪外阴擦洗消毒不严格甚至省略了这道程序。特别是一些个体养殖户，由于卫生消毒意识淡薄，输精时很少对母猪外阴进行擦洗消毒。这可能会把外阴及其周围的污物和病原菌由输精管带入生殖道内，影响输精效果，还可能造成生殖道感染。
二是数精时输精的速度应适当，过快输精可能在输精后几分钟或十几分钟后精液倒流。要控制输精瓶的高低来调节输精时间，输精时间要求3~5分钟，输完后，应在防止空气进入母猪生殖道的情况下，把输精管后端一小段折起，放在输精瓶中，使其滞留在生殖道内3～5分钟，让输精管慢慢滑落。
三是在输精前后任何应激因素都会对受精产生不利影响。在输精后不要用力拍打母猪臀部，输精后拍打母猪臀部会使母猪肌肉收缩，而暂时避免精液倒流，但受到惊吓后体内会释放肾上腺素，对搞催产素等生殖激素的作用，将会减弱子宫收缩波，而影响到精液向子宫深部运行，对卵子受精有不利影响。
四是输精结束后，应在10分钟内避免母猪卧下，最好避免母猪饮过冷的水。母猪卧下使其腹压增大，易造成精液倒流，如果母猪要卧下，应轻轻驱赶，但不可粗暴对待，以免造成应激；饮冷水，可能会刺激胃肠和子宫收缩而造成精液倒流。
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