工作人员进入生产区净道和猪舍要经过洗澡、更衣、紫外线消毒。养殖场一般谢绝观赏，严格控制外来人员，必需进入生产区时，要洗澡，换场区工作服和工作鞋，并遵守场内防疫制度，按指定路线行走。进入养殖场的人员，必需在场门口更换靴鞋，并在消毒池内进行消毒，场门口设消毒池，用 2% 3% 火碱溶液（氢氧化钠） 3 天更换一次。
有条件的养殖场，生产区入口设置消毒室，消毒室内洗澡、更换衣物，穿戴清洁消毒好的工作服、帽和靴经消毒池后进入生产区。消毒室经常保持干净、整洁。工作服、工作靴和更衣室定期洗刷消毒，每立方米空间用 42 毫升福尔马林熏蒸消毒 20 分钟。工作人员在接触畜群、饲料、种蛋等之前必须洗手，并用 1:1000 新洁尔灭溶液浸泡消毒 3 5 分钟。
猪舍周围环境每 2 3 周用 2% 火碱消毒或撒生石灰一次，场周围及场内污水池、排粪坑、下水道入口，每月用漂白粉消毒一次。大门口猪舍人口设消毒池，使用 2% 火碱或 5% 来苏儿溶液，注意定期更换消毒液。每隔 1 2 周，用 2% 3% 火碱溶液（氢氧化钠）喷洒消毒道路；用 2% 3% 火碱，或 3% 5% 甲醛或 0.5% 过氧乙酸喷洒消毒场地。
被病畜（禽）排泄物和分泌物污染的地面土壤，可用 5% 10% 漂白粉溶液、百毒杀或 10% 氢氧化钠溶液消毒。停放过芽抱所致传染病（如炭疽、气肿疽等）病畜尸体的场所，或者是此种病畜倒毙的地方，应严格加以消毒，首先用 10% 20% 漂白粉乳剂或 5% 10% 优氯净喷洒地面，然后将表层土壤掘起 30 厘米左右，撒上干漂白粉并与土混合，将此表土运出掩埋。运输时应用不漏土的车以免沿途漏撒，如无条件将表土运出，则应加大漂白粉的用量（ 1 平方米面积加漂白粉 5 千克）将漂白粉与土混合，加水湿润后原地压平。
每批猪只调出后要彻底清扫干净，用高压水枪冲洗，然后进行喷雾消毒或熏蒸消毒。据试验，采用清扫方法，可以使畜禽舍内的细菌减少 21.5% 如果清扫后再用清水冲洗，则畜禽舍内细菌数即可减少 54% 60% 清扫、冲洗后再用药物喷雾消毒，畜禽舍内的细菌数即可减少 90%
用化学消毒液消毒时，消毒液的用量一般是以畜禽舍内每平方米面积用 1 1.5 升药液。消毒时，先喷洒地面，然后墙壁，先由离门远处开始，喷完墙壁后再喷天花板，最后再开门窗通风，用清水刷洗饲槽，将消毒药味除去。进行畜禽舍消毒时，也应将附近场院以及病畜、禽污染的地方和物品同时进行消毒。
一般情况下，猪舍应每年进行两次（春秋各一次）预防消毒。进行猪舍预防消毒的同时，凡是猪停留过的处所都需进行消毒。采取 “ 全进全出 ” 管理方法的机械化养猪场，应在每次全出后进行消毒。产房的消毒在产仔结束后再进行一次。
猪舍的预防消毒，也可用气体熏蒸消毒，所用药品是福尔马林和高锰酸钾。方法是依照猪舍面积计算所需用的药品量。一般每立方米空间，用福尔马林 25 毫升，水 12.5 毫升，高锰酸钾 25 克（或以生石灰代替）计算好用量以后将水与福尔马林混合。猪舍（或其他畜舍）室温不应低于正常的室温（ 8 15 ℃ ）将畜、禽舍门窗紧闭。其后将高锰酸钾倒入，用木棒搅拌，经儿秒钟即见有浅蓝色刺激眼鼻的气体蒸发进去，此时应迅速离开畜禽舍，将门关闭。经过 12 24 小时后方可将门窗打开通风。
发生各种污染病而进行临时消毒及终末消毒时，用来消毒的消毒剂随疫病的种类不同而异。一般肠道菌、病毒性疾病，可选用 5% 漂白粉或 1% 2% 氢氧化钠热溶液。但如发生细菌芽孢引起的污染病（如炭疽、气肿疽等）时，则需使用 10% 20% 漂白粉乳、 1% 2% 氢氧化钠热溶液或其他强力消毒剂。消毒畜禽的同时，病畜禽舍、隔离舍的出入口处应放置设有消毒液的麻袋片或草垫。
常用的药物有 0.2% 0.3% 过氧乙酸，每立方米空间用药 20 40 毫升，也可用 0.2% 次氯酸钠溶液或 0.1% 新洁尔灭溶液。 0.5% 以下浓度的过氧乙酸对人畜无害，为了减少对工作人员的安慰，消毒时可佩戴口罩。
本消毒方法全年均可使用，一般情况下每周消毒 1 2 次，春秋疫情常发季节，每周消毒 3 次，有疫情发生时，每天消毒 1 2 次。带猪消毒时可以将 3 5 种消毒药交替进行使用。
妊娠母猪在分娩前 5 天，最好用热毛巾对全身皮肤进行清洁，然后用 0.1% 高锰酸钾水擦洗全身，临产前 3 天再消毒 1 次，重点要擦洗会阴部和乳头，保证仔猪在出生后和哺乳期间免受病原微生物的感染。
哺乳期母猪的乳房要定期清洗和消毒，一般每隔 7 天消毒 1 次，严重发病的可按照污染猪场的状况进行消毒处置。
新生仔猪，分娩后用热毛巾对全身皮肤进行擦洗，要保证舍内温度（舍温在 25 ℃以上）然后用 0.1% 高锰酸钾水擦洗全身，再用毛巾擦干。
定期对保温箱、补料槽、饲料车、料箱、针管等进行消毒。一般先将用具冲洗干净后，可用 0.1% 新洁尔灭或 0.2% 0.5% 过氧乙酸消毒，然后在密闭的室内进行熏蒸。
患传染病和寄生虫病病畜、粪便的消毒方法有多种，如焚烧法、化学药品消毒法、掩埋法和生物热消毒法等。实践中最常用的生物热消毒法，此法能使非芽孢病原微生物污染的粪便变为无害，且不丧失肥料的应用价值。
对于猪场的垫料，可以通过阳光照射的方法进行。这是一种最经济、最简单的方法，将垫草等放在烈日下，曝晒 2 3 小时，能杀灭多种病原微生物。对于少量的垫草，可以直接用紫外线等照射 1 2 小时，可以杀灭大部分微生物。