肥料利用率是指施入土壤中的某种肥料主要养分，作物当季吸收利用的百分数。施到土攘中的肥料，并不能全部为作物吸收利用，其利用率的大小，与肥料种类、施肥方法、土攘性质和气候条件等有密切关系。一般肥料利用率越高，肥料的增产效益越大。肥料中有效成分的损失也越小。据测定一般氮肥的利用率为30%-50%，磷肥为20%-25%，钾肥为50%-60%。作物对有机肥料养分当年的利用率，以人粪尿最高，为50%左右；厩肥或堆肥，不超过20%-30%。氮肥与磷钾肥料、化学肥料与农家肥料混合施用，由于肥料的相互作用，能促进作物各个器官均衡发展，增加根的吸收能力和光合效率，减少肥料损失，能使各种肥料利用率相应提高。
肥料不同施用方法也影响肥料利用率。磷肥集中施比撒施利用率高。氮素化肥如果表施，由于流失和挥发等影响，其利用率较低，而采用深施方法，便可提高利用率。氮肥深施就是将氮肥施入耕层深处，覆土6.6-9.9厘米，不使肥料露于土表的施肥方法。氮肥表施，其肥效一般维持10-20天，而深施可长达30-50天。