秋季既是家兔换毛期和母兔分娩期，又是各种疾病的高发时期。由于秋季昼夜温差大，家兔的抗病能力下降，如果忽视了疾病防治，将会造成不必要的损失，做好秋季家兔疾病防治至关重要。具体防治方法是：
一要搞好兔舍的卫生清洁。坚持每天清扫兔舍，定期对兔舍、食具和笼具洗刷消毒，每天仔细观察兔群健康状况，发现异常，应立即隔离并详细检查，查清病因及时治疗。秋季早、晚气温较低，应注意保温，保持空气流通，不喂带露水的草料。
二要抓紧接种疫苗。用兔瘟灭活苗，每只皮下注射1毫升，5~7天后产生免疫力，免疫期6个月，兔瘟，A型魏氏梭菌病二联苗，注射后兔瘟3天产生免疫力，其免疫期前者1年，后者6个月，该疫苗还可作紧急预防兔瘟使用。
三要预防传染病。仔兔用诺氟沙星片或复方敌菌净或复方新诺明每千克体重5毫克，一日内服2次，连用5天，可防家兔球虫病、大肠杆菌病、肠炎等细菌感染。
青年兔可用磺胺二甲基嘧啶片或强力霉素，预防球虫病、巴氏杆菌、肺炎球菌、溶血性链球菌病的发生。用喹乙醇可预防巴氏杆菌和魏氏梭菌病的发生。
孕兔分娩前3天在饲料中添加新诺明或磺胺二甲基嘧啶片每千克体重0.2克，每日2次，连用5天，可有效地预防母兔乳房炎的发生。
四要做好兔群普遍驱虫。用丙硫咪唑，有驱除线虫、绦虫、绦虫蚴及吸虫的作用；用盐酸左旋咪唑，有驱除肠道线虫，网尾线虫的作用；用阿维菌素或毛虫丁针剂，有驱杀兔体内多种寄生虫的作用。用药剂量按照药品说明书使用即可。