蜈蚣的抗立竿见影力较强，一般不得病，但是如要饲养不得法也会使蜈蚣患病。现将蜈蚣的主要疾病及防治方法介绍如下：
一、绿霉病：又叫绿僵霉菌病，人工养殖蜈蚣的主要疾病。 6 月中旬到 8 月底，由于气温高、湿度大，以及食物发生霉变，蜈蚣容易受到病菌的感染而得此病。受感染的蜈蚣早期主要是关节的皮肤上出现黑色或绿色的小斑点，以后逐步扩大；继而体表失去光泽，腹部下面出现黑点，食欲减退、行动呆滞，最终因拒绝取食消瘦而死亡。发生该病的主要原因是饲养环境的湿度过大，或池内残存的食物腐烂霉变所致。
防治方法： 1 清除霉变的食物，车新鲜的活食，坚持好养殖池内的卫生，并进行消毒灭菌。 2 调节养殖池内的温湿度，坚持通风散湿。 3 对发病的蜈蚣可用青霉素 0.25 克加水 1 公斤喷雾消毒或加水饮用。 4 可用食母生 0.6 克、土霉素 0.25 克、氯霉素 0.25 克共研成粉末，同 400 克饲料拌匀喂得病的蜈蚣，直到病愈。
二、腹胀病：蜈蚣多在秋后阴雨低温时期患此病，多因多食和低温所致。病蜈蚣早期头部呈紫红色，毒钩全张、不食或少食、腹部胀大、行动缓慢，发病 1 周左右后死亡。
防治方法： 1 用食母生 1 克加水 500 克拌匀，让其吸吮，并提高温度。 2 用磺胺片 0.5 片研细后加 300 克饲料拌匀；也可用氯霉素 0.25 克加 300 克饲料拌匀，隔日喂食，直至病愈。
三、脱壳病：由于蜈蚣栖息场所过于湿润，使真菌在躯体寄生所引起。初期表示为不安躁动、来回爬动，后期表示为无力、行动滞缓，最终因不食不动而死亡。
防治方法：土霉素 0.25 克、食母生 0.6 克、钙片 1 克，共研成细末加 400 克饲料搅匀，连喂多日，直至病愈。
四、蚁害：正在蜕皮或产卵孵化期的蜈蚣抵抗能力弱，此时蚂蚁进入后会群起而攻之，致使蜕皮时的蜈蚣被咬死，或使孵化中的雌蜈蚣弃卵而逃。
防治方法： 1 养殖池周围挖一圈围沟，注入水，防止蚂蚁进入。 2 可用水果或其他甜食把蚂蚁用水果或其他甜食把蚂蚁诱引开后用开水烫死。
五、流产：孕蜈蚣多因为受到干扰、翻动、喧闹或异物的直接抚慰所致，因此在孕期应酬坚持恬静，更不能经常翻动。
此外，还要防止老鼠吞食成虫、幼体和卵而造成危害。