种蛋的孵化率受很多因素的影响，除孵化条件外有以下因素：
一、遗传因素
由于家禽种类、品种(系)的遗传结构不同，种蛋的孵化效果也有差异。一般蛋用禽的孵化率较高，肉用禽的孵化率较低，近交时孵化率降低，近交系数提高1%，孵化率下降0.4%。
二、营养水平
鹅蛋的养分是由母鹅将口粮中养分分解转化而成。胚胎的生长发育必须靠蛋中的养分，特别是日粮中的维生素、微量元素等更为重要，否则，导致受精率降低，胚胎出现畸形、死亡等，孵化后期无力磁壳、体弱、先天营养不足的死胚明显增加。
三、年 龄
孵化率随母鹅产蛋日龄的增加而降低。青年鹅产的蛋比老年鹅产的蛋孵化率高。
四、管理水平
鹅舍的温度、通风，垫草状况等均与孵化率有关。垫料潮湿，种蛋不及时收集等，导致种蛋较脏，间接地影响孵化率。