因为种鸡场采用的饲养工艺和设备不同，种鸡的饲养方式也就各异，种鸡的配种方式也就不一样。总的来说，种鸡的配种方式不过乎两种：天然交配和人工授精。
天然交配的配种方式，主要在平面饲养前提下的种鸡使用。平面饲养可以是地上饲养、网上或板条网板上饲养。这些都是大群饲养的种鸡采用，少者几十只几百只，多者几千只。一般以1000只左右一群为宜。种鸡按划定的公母配比进行饲养治理，任公母鸡彼此间自由交配，收集种蛋。平养鸡的种鸡要设置产蛋窝(箱)，并且必需及时拾捡鸡蛋，否则轻易把蛋弄脏和造成破损。平养的种蛋一般较脏，蛋壳的污染程度较高，特别是地面平养的鸡，由于鸡爪直接接触地面的土壤和粪便。平养的最大好处是收容种蛋利便，只要公母比例适当，种蛋受精率就有保证。但要格外加强清洁卫生工作，如打扫粪便，勤换鸡窝的垫料等。天然交配情况下，要留意公母鸡的适当比例备留一些公鸡，当泛起公鸡伤亡时作必要的增补，否则会影响受精率，一定要选留腿脚健壮的公鸡。平养种鸡感染疾病的机会较多，特别是沙门氏杆菌病的净化工作比较难题，平养方式一般都采用网上平养，这样鸡不与粪便接触，染病的机会就会大大减少，平养的种鸡因为鸡群较大，发生啄肛的现象较多，特别是开产初期，因此需要责任心很强的职员来治理鸡群。
目前，一般种鸡场都采用笼养方式饲养种鸡。笼养种鸡可以充分利用鸡舍面积，增加饲养容量，卫生前提好，治理利便，种蛋比较清洁，蛋壳受污染的机会少，种蛋破损也较低。例如：用小群种鸡笼(俗称配种笼)饲养，一般养24只母鸡和2～3只公鸡，公母混养，自由交配。无需设置产蛋窝，母鸡产蛋直接滚到网底的集蛋槽上，按期收集种蛋，这比平养自由交配的种鸡要优胜得多。当然，笼养种鸡的一些缺点如蛋的破损率、鸡的伤亡率较高等仍旧存在。
种鸡笼养实行人工授精，是当今最提高前辈的繁殖方法。这种配种方式可以大大减少种公鸡的饲养量，充分利用种用价值高的优秀公鸡，大大降低公鸡的饲养本钱，能够更充分地利用鸡舍面积，公母鸡的死亡率都较低，公母比例可从平养时的1：10～15扩大到1：35～40，并且可以按照供种需要随时提供受精率高的种蛋。
人工授精技术经由1周的培训就能基本把握，与平养种鸡比拟，需要将附加的劳动力，组织一个专门的人工授精小组。而且要严格执行人工授精的技术，每5～7天输精一次，否则种蛋的受精率就会受影响，这是一项当真而又细致的工作。鸡的人工授精技术在海内外的普及，已证明其提高前辈性和显著的优胜性。